丸劑在生產過程中原料藥帶菌是汙染的主要環節₪✘·✘·，應採取適當的方法進行滅菌₪✘·✘·，常用方法有水洗法☁·₪、氣體滅菌法☁·₪、熱壓滅菌法等₪✘·✘·，滅菌不應破壞藥物的有效成分✘▩▩·↟。
全自動水丸機等制丸工具☁·₪、裝置☁·₪、生產環境及個人均應注意清潔衛生₪✘·✘·，以提高丸劑的質量✘▩▩·↟。
丸劑乾燥時應注意經常翻動✘▩▩·↟。以免乾溼摻半或爆裂₪✘·✘·，影響質量✘▩▩·↟。採取不同的方法✘▩▩·↟。含芳香性藥物或貴重藥物的丸劑✘▩▩·↟。
水丸機制丸藥材研粉₪✘·✘·，有時不宜共研₪✘·✘·，如貴重類☁·₪、粉末類及揮發性藥物應分別研細₪✘·✘·，再行稱準混合₪✘·✘·，以防止與原定分量之差異✘▩▩·↟。粘合劑與藥物細粉混合應按一定比例進行✘▩▩·↟。
全自動水丸機制丸時₪✘·✘·，粘合劑與藥粉混合應充分均勻₪✘·✘·，粘合劑溫度不宜過高₪✘·✘·，尤其組方中含有揮發性或遇熱易破壞有效成分的藥物時₪✘·✘·，更須注意₪✘·✘·，以免影響藥效✘▩▩·↟。
丸劑貯存應根據藥物性質✘▩▩·↟。多用瓷制或玻璃制的容器貯存₪✘·✘·，一般丸劑可用蠟紙封存✘▩▩·↟。應注意防潮☁·₪、防黴☁·₪、防蟲蛀✘▩▩·↟。水丸☁·₪、糊丸及濃縮丸均不宜久貯✘▩▩·↟。
如果需要製造的的藥丸中含有豐富的纖維₪✘·✘·，藥丸的表面容易出現粗糙現象₪✘·✘·，如果在製作藥丸的藥料是放入的藥粉過粗；對丸子外觀要求較高的₪✘·✘·，可放入足夠的蜂蠟₪✘·✘·，也就是潤滑劑✘▩▩·↟。製作的藥料中含有礦物質☁·₪、貝殼類的藥物₪✘·✘·，並且是過量了₪✘·✘·，那麼一樣會導致藥丸子表面粗糙✘▩▩·↟。
在拌料時注意所舔加水（蜂蜜）量₪✘·✘·，水量過多製出藥丸過稀容易變形₪✘·✘·，水（蜂蜜）量過少藥丸沒有粘性₪✘·✘·，所以加水量也取決製作出的藥丸是否美觀✘▩▩·↟。具體操作方法如下╃₪：
1.將藥物曬乾後₪✘·✘·，粉碎加工成粉末₪✘·✘·，細度為80-100目✘▩▩·↟。熟地等藥物₪✘·✘·，可採用絞肉機絞擠方法₪✘·✘·，反覆多次即可達到泥槳狀物料✘▩▩·↟。
2.藥粉☁·₪、蜂蜜☁·₪、少量的糊精（藥面與蜂蜜的比例為10∶1）₪✘·✘·，攪拌成麵糰狀✘▩▩·↟。值得注意的是₪✘·✘·，藥粉攪拌的粘性要適中₪✘·✘·，不能太軟或太硬₪✘·✘·，要攪拌得均勻不粘手✘▩▩·↟。
3.糊精必須加水熬成糊狀₪✘·✘·，熬製時必須用勺子不停的攪拌✘▩▩·↟。
4.使用過程中嚴禁在出丸軸上加食用油₪✘·✘·，否則藥丸粘刀不容易脫落✘▩▩·↟。
